S’il s’inscrit dans la filiation des cabinets de curiosité lorrains, le Muséum-Aquarium de Nancy a pris sa forme actuelle sous l’impulsion de Lucien Cuénot, naturaliste et biologiste nancéien, nommé directeur du cabinet d’histoire naturelle en 1898. Auparavant regroupées à la faculté des sciences, les collections d’histoire naturelle sont scindées par discipline (géologie, botanique et zoologie) au début du XXe siècle. Le bâtiment actuel, construit par les architectes nancéiens Jacques et Michel André, est inauguré en 1933 afin d’accueillir l’Institut de zoologie et les collections qui y sont rattachées. Initialement dédiées à l’étude et l’enseignement, celles-ci se sont progressivement diversifiées et rassemblent désormais plus de 320 000 spécimens. En 2013, l'Ecole Nationale Supérieure de Géologie confère la gestion de sa collection paléontologique historique, riche de plus de 200 000 échantillons, au Muséum-Aquarium de Nancy. L'établissement conserve aujourd'hui plus de 800 types et figurés, ainsi qu'une vingtaine de représentants d'espèces éteintes.