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Annotate

Annotate-On est un outil ergonomique de prise de mesures des caractères morphométriques et de documentation par annotation des doubles numériques des spécimens naturalistes et des sources photographiques et sonores diverses.

Annotate-On est mis librement à la disposition de la communauté scientifique pour mener des recherches sur des collections naturalistes principalement. Il contient des outils pour réaliser facilement et rapidement des analyses morphologiques et morphométriques sur des images : mesures physiques (longueurs, périmètres, surfaces, angles), marquage et comptage de points d’intérêts, et annotations descriptives.

Les images peuvent provenir de sources variées : outre la base de données de l’infrastructure Récolnat, toute URL d’images en ligne, ou encore les images d’un disque dur, d’un appareil photographique, d’un microscope, etc. Ces bibliothèques d’images peuvent être classées à l’aide de l’outil de gestion de mots-clés du logiciel.

Les annotations effectuées avec Annotate-On sont structurées par une liste de caractères descriptifs éditables (observations ou mesures) dédiés à une étude, une espèce, une hypothèse, etc. Ce modèle peut être importé depuis le logiciel

Xper 3

, Logiciel de gestion de données sur la biodiversité, ou exporté vers lui. Les observations et mesures fondées sur ces modèles sont exportables vers des tableurs, des logiciels de traitement de données, l’application R ou encore des modules d’apprentissage profond (deep learning).

Le lien direct entre Annotate-On et la base de données Récolnat permet d’importer directement des images et des métadonnées depuis les 10 millions de spécimens disponibles en ligne.

Guide annotate:

Annotate-on documentation utilisateurs

Téléchargement:
Version actuelle

VERSION 2.4.0

Annotate v2.4.0 Windows

Annotate v2.4.0 MacOSX

Le téléchargement est en libre accès cependant vous devez citer l'outil dans vos résultats scientifiques en mentionnant : RECOLNAT(ANR-11-INBS-0004) [Matériels et méthodes ou remerciements]

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